Gelişmiş Arama

Basit öğe kaydını göster

dc.contributor.authorÜnlü, Nihan
dc.contributor.authorÖzgen, Arzu
dc.date.accessioned2024-05-11T22:28:03Z
dc.date.available2024-05-11T22:28:03Z
dc.date.issued2024en_US
dc.identifier.issn2536-4499
dc.identifier.issn2602-2605
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11363/7341
dc.description.abstractAim: Group IIA bacteriocins, which contain unmodified amino acids and have antimicrobial activity, are a very broad group. Sakacins in this group are bacteriocins produced by Lactobacillus sakei. The most wellknown sakacins are Sakacin A, G, K, P, and Q. In particular, Sakacin A and P are well characterized. This study aims to examine the interaction between a single monomer of PVA polymer and Sakacin P bacteriocin. Method: In t this study, the interaction of a single monomer of PVA polymer, which is among the watersoluble, biocompatible synthetic polymers, and Sakacin P bacteriocin, which has a protein structure, was investigated by molecular docking method. Results: As a result of our molecular docking study, the presence of binding affinity between the C2H4O monomer of PVA selected as the ligand and the Sakacin P protein selected as the receptor was determined. Conclusion: According to the results of the analysis, the presence of a strong inhibitor was detected between the ligand and the target. Therefore, this study can serve as a template for polymer-bacteriocin materials to be produced in the laboratory.en_US
dc.description.abstractAmaç: Modifiye edilmemiş amino asitler içeren ve antimikrobiyal aktiviteye sahip olan Grup IIA bakteriyosinler çok geniş bir gruptur. Bu gruptaki sakasinler, Lactobacillus sakei tarafından üretilen bakteriyosinlerdir. En iyi bilinen sakasinler Sakacin A, G, K, P ve Q'dur. Özellikle Sakacin A ve P, iyi karakterize edilmiştir. Bu çalışma, PVA polimerinin tek bir monomeri ile Sakacin P bakteriyosin arasındaki etkileşimi incelemeyi amaçlamaktadır. Yöntem: Bu çalışmada suda çözünebilen, biyouyumlu sentetik polimerlerden PVA polimerinin tek bir monomeri ile protein yapıya sahip Sakacin P bakteriyosinin etkileşimi moleküler yerleştirme yöntemi ile incelenmiştir. Bulgular: Moleküler docking çalışması sonucunda ligand olarak seçilen PVA'nın C2H4O monomeri ile reseptör olarak seçilen Sakacin P proteini arasında bağlanma afinitesinin varlığı belirlenmiştir. Sonuç: Analiz sonuçlarına göre ligand ile hedef arasında güçlü bir inhibitör varlığı tespit edilmiştir. Bu nedenle bu çalışma, laboratuvarda üretilecek polimer-bakteriosin materyalleri için bir şablon görevi görebilir.en_US
dc.language.isoengen_US
dc.publisherİstanbul Gelişim Üniversitesi Yayınları / Istanbul Gelisim University Pressen_US
dc.relation.isversionofhttps://doi.org/10.38079/igusabder.1224944en_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectSakacin Pen_US
dc.subjectmolecular dockingen_US
dc.subjectpolyvinyl alcoholen_US
dc.subjectSakacin Pen_US
dc.subjectmoleküler yerleştirmeen_US
dc.subjectpolivinil alkolen_US
dc.titleInvestigation of Polyvinyl Alcohol (PVA)-Sakacin P Interaction by Molecular Docking Methoden_US
dc.title.alternativeMoleküler Yerleştirme Yöntemi ile Polivinil Alkol (PVA)-Sakasin P Etkileşiminin İncelenmesien_US
dc.typearticleen_US
dc.relation.ispartofİstanbul Gelişim Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisien_US
dc.departmentİstanbul Gelişim Üniversitesien_US
dc.authoridhttps://orcid.org/0000-0001-5772-2838en_US
dc.authoridhttps://orcid.org/0000-0003-2104-6019en_US
dc.identifier.issue22en_US
dc.identifier.startpage73en_US
dc.identifier.endpage80en_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.institutionauthorÜnlü, Nihan
dc.institutionauthorÖzgen, Arzu


Bu öğenin dosyaları:

Thumbnail

Bu öğe aşağıdaki koleksiyon(lar)da görünmektedir.

Basit öğe kaydını göster